Вы шкаф на балконе от пола до потолка, разделенный на высокую секцию и на тумбочку, можете сделать?

Можем, конечно. Причем, высокая секция может быть оборудована как двумя, так и четырьмя дверцами, а тумба стать как бы продолжением подоконника. Получится многофункциональный шкаф на балкон, полностью встроенный в отведенное для него место. По поводу того, что вы называете «вырезать дырку под подоконник», - это лучше пусть наш мастер посмотрит по месту. Он же сможет подсказать вам и более оптимальное решение конструкции вашего шкафа с учетом ваших предпочтений.